Este juego tiene dos finales distintos:

- El primer final aparece al acabar los cinco primeros planetas (Bomber, Primus, Kanatia, Mazone y Garaden), es decir, al destruir al enemigo final del Planeta 5, Fase 7: En este final, en primer lugar, aparecerá la princesa Milliam junto a Pibot (su robot), condecorando y felicitando a Bomberman por haberla rescatado del imperio Garaden, mientras un montón de personajes iguales a Bomberman pero de distintos colores, dan saltos de alegría. Por último, aparecerá una imagen del planeta Bomber, mientras por la pantalla irán pasando los créditos del juego (la lista de los programadores que han intervenido en el juego).

 

- El segundo final aparece al acabar el sexto planeta (Gossick), es decir, al destruir al enemigo final del Planeta 6, Fase 3: En este final, aparecerán las naves espaciales de Bomberman, de la princesa Milliam y del Bomberman negro. A continuación, veremos como Bomberman agradecerá a la princesa y al Bomberman negro su ayuda en la invasión del planeta Gossick, y por último, las naves se alejarán por el espacio y volveremos a la pantalla del título.