Aunque el juego es una aventura contínua, lo hemos dividido por pasos para una mejor comprensión:

- 1er Paso. Llegar a la Ciudad Reloj

- 2º Paso. Transformarnos de nuevo en Link niño

- 3er Paso. Completar el Templo del Bosque Catarata

- 4º Paso. Completar el Templo del Pico Nevado

- 5º Paso. Completar el Templo de la Gran Bahía

- 6º Paso. Completar el Templo de la Torre de Piedra

- 7º Paso. Derrotar a la Máscara de Majora en la Luna