En la pantalla "Misiones" puedes ver diversas misiones que puedes intentar realizar cuando estés jugando (a este menú se llega desde el menú principal del juego, o desde el menú de pausa).

Cuando completas una misión cumpliendo sus condiciones, obtendrás una recompensa.

Las misiones pueden ser Campaña o Modo Asalto.
Puedes tener hasta 25 misiones simultáneas sin completar en cada modo de juego. Hasta que no completes alguna de ellas, no aparecerán nuevas.

El estado de la misión se indica mediante los siguientes iconos:
| Logro. Se obtiene mediante progreso en el juego. |
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| Derrota. Se obtiene derrotando a ciertos enemigos. |
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| Se busca (solo modo Asalto). Derrota a enemigos poderosos (suelen ser otros jugadores que entrar a través de StreetPass). Sobre la misión en la que aparece verás una corona |
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| Objetos de apoyo (Solo modo Campaña). Obtener objetos para la Campaña. |
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| Infección (Solo modo Asalto). Usa StreetPass para progresar. |
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| En curso. | |
| Puede completarse. Puede seleccionarse la misión para obtener a recompensa. | |
| Puede completarse, pero no en condiciones especiales. | |
| Completada. Estas misiones se eliminan automáticamente al obtener nuevas misiones. | |
| Capítulo 1: Objetivo: Superar episodios 1-3. Recompensa: Niveles 1-7 del modo Asalto desbloqueados. |
| Capítulo 2. - Objetivo: Superar episodios 4-6. - Recompensa: Niveles 8-12 del modo Asalto desbloqueados. Nuevo traje. |
| Capítulo 3. - Objetivo: Superar episodios 7-9. - Recompensa: Niveles 13-17 del modo Asalto desbloqueados. |
| Capítulo final. - Objetivo: Superar episodios 10-12. - Recompensa: Niveles 18-20, extra y dificultad INFIERNO del modo Asalto desbloqueados. |
| Fácil superado. - Objetivo: Superar nivel de dificultad FÁCIL o superior - Recompensa: Piezas de personalización Disparo cargado 3 (Para campaña) |
| Normal superado. - Objetivo: Superar nivel de dificultad NORMAL o superior. - Recompensa: Escopeta Hydra (Para campaña). |
| Señal secreta 1. - Objetivo: Escanear 1 huella de mano oculta. - Recompensa: Hierba verde (Para campaña). |
| Señal secreta 15. - Objetivo: Escanear 15 huellas de mano ocultas - Recompensa: Fusil PSG1(Para campaña). |
| Señal secreta 30. - Objetivo: Escanear 30 huellas de mano ocultas - Recompensa: Pistola G18 (Para campaña). |
| Maestro del esquive. - Objetivo: Esquivar 20 veces. - Recompensa: Piezas de personalización Atar 1 (Para campaña). |
| Caza B.O.W.s. - Objetivo: Derrotar a 150 enemigos. - Recompensa: Pistola PC356 (Para campaña). |
| Investigador. - Objetivo: Escanear todos los enemigos. - Recompensa: Piezas de personalización Vengador 2 (Para campaña). |
| Puño fácil. Objetivo: Realiza 10 ataques cuerpo a cuerpo a plena carga. Recompensa: Piezas de personalización Cargador largo 2 (Para campaña). |
| Desafiador distante. - Objetivo: Superar nivel de dificultad FÁCIL o superior sin usar hierbas verdes ni el lanzacohetes infinito. - Recompensa: Piezas de personalización Autocargador (Para campaña). |
| INFIERNO superado. - Objetivo: Superar el nivel de dificultad INFIERNO. - Recompensa: Lanzacohetes infinito (Para campaña). |
| ZANJA superado. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en ZANJA. - Recompensa: Modo Asalto dificultad SIMA desbloqueada. Nuevo traje (Raymond 1). |
| ZANJA; todo superado, calif. S. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en ZANJA con calificación S. - Recompensa: Honor - Color 1. |
| SIMA superado. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en SIMA. - Recompensa: Modo Asalto dificultad ABISMO desbloqueada. Nuevo traje (Jessica 2). |
| SIMA; todo superado, calif. S. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en SIMA con calificación S. - Recompensa: Honor - Color 2. |
| ABISMO superado. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en ABISMO. - Recompensa: Nuevo traje (O'Brian). |
| ABISMO; todo superado, calif. S. - Objetivo: Superar todos los niveles en modo Asalto en ABISMO con calificación S. - Recompensa: Honor - Color 3. |
| Barco fantasma 100% superado. - Objetivo: Encontrar el auténtico objetivo en el barco. - Recompensa: Nuevo traje (Morgan). |
| Nivel 5. - Objetivo: Alcanzar nivel de jugador 5. - Recompensa: Nuevo traje (Jill 2). |
| Nivel 10. - Objetivo: Alcanza nivel de jugador 10. - Recompensa: Nuevo traje (Jessica 1). |
| Nivel 20. - Objetivo: Alcanza nivel de jugador 20. - Recompensa: Nuevo traje (Parker 2). |
| Nivel 30. - Objetivo: Alcanza nivel de jugador 30. - Recompensa: Nuevo traje (Chris 2). |
| Nivel 40. - Objetivo: Alcanza nivel de jugador 40. - Recompensa: Nuevo traje (Jessica 3). |
| Nivel 50. - Objetivo: Alcanza nivel de jugador 50. - Recompensa: Nuevo traje (Quint 1). |
| Arma legendaria. - Objetivo: Obtener un arma superespecial. - Recompensa: Nuevo traje (Parker 3) |
| Asaltante legendario. - Objetivo: Obtener todas las armas superespeciales. - Recompensa: Nuevo traje (Norman). |
| 50 misiones. - Objetivo: Completar 50 misiones. - Recompensa: Nuevo traje (Keith 2) |
| 100 misiones. - Objetivo: Completar 100 misiones. - Recompensa: Nuevo traje (Quint 2) |
| 200 misiones. - Objetivo: Completar 200 misiones. - Recompensa: 10000 PB |
| Derrotar a los hunters. - Objetivo: Peces deformes y gigantes. Derrota a 15. - Recompensa: 10.000 PB. |
| Derrotar a los Oozes. - Objetivo: Muertos vivientes otrora humanos... Derrota a 20. - Recompensa: 10.000 PB. |
| Derrotar a los Ghiozzos. - Objetivo: Peces deformes y gigantes. Derrota a 15. - Recompensa: 10.000 PB. |
| Derrotar a los Sea Creepers. - Objetivo: Sombras repulsivas en el agua. Derrota a 5. - Recompensa: 10.000 PB. |
| Derrotar a los Scarmigliones. - Objetivo: B.O.W.s reptilianos producidas en serie. Derrota a 20. - Recompensa: 20.000 PB |
| Derrotar a los Farfarellos. - Objetivo: Estas criaturas serán invisibles a tus ojos. Pero si tienes la destreza suficiente, podrás acabar con 5 de ellas. - Recompensa: 25.000 PB |
| Derrotar a forma final de Abyss. - Objetivo: Rey del abismo que puede controlas poderosos fantasmas. Elimínalo. - Recompensa: 40.000 PB |
| Derrotar a los Draghignazzos. - Objetivo: Criaturas gigantes y desfiguradas con caparazón que desvía balas. Derrota a 5. - Recompensa: 30.000 PB |
| Derrotar a Draghignazzo bebé. - Objetivo: La cría de una criatura gigante y desfiguradas con caparazón. Pequeña pero matona. Derrota a 10. - Recompensa: 40.000 PB |
* Nota: Además de las misiones que hemos indicado en el modo Campaña y en el modo Asalto, podrán aparecer más, pero estas son las más importantes