Durante el Capítulo 4: ¡Resolvamos el caso misterioso! de la chica, te encomendarán la misión Desafío de fusión. A partir de ese momento podrás realizar fusiones entre Yo-kai y entre objetos hablando con el Sr. Zen en el Templo Shoten de Cumbres Floreadas (Floridablanca).
Con el chico podrás realizar fusiones en EE.UU. hablando con Thomas, el sacerdote que está dentro de la iglesia de East Pine. Te dará la opción de realizar fusiones después de completar la misión Pasión por la fusión durante el Capítulo 4: En busca de las reliquias perdidas del chico.

Al hablar con el Sr. Zen en Floridablanca o con Thomas en EE.UU., verás que aparecen tres pestañas, una con Yo-kai, otra con objetos y otra con todo mezclado..
Ahora podrás fusionar
dos Yo-Kai entre sí o un Yo-Kai con un objeto.
Cada vez que seleccionas un Yo-Kai o un objeto, se oscurecerán todos los objetos o Yo-kai con los que no se pueden fusionar y solo se quedará iluminado el que sea compatible.


Al realizar la fusión, conseguirás a un nuevo Yo-kai.

Los Yo-kai que se pueden fusionar son los siguientes.
| YO-KAI QUE SE PUEDEN FUSIONAR |
| Yo-kai 1 | Yo-kai 2 | Se fusionan en |
|---|---|---|
| 026. Yelmandante | 160. Lorigón | 027. Juntollero |
| 082. Preguntio | 323. Don Arenito | 083. Respondio |
| 118. Telespejo | 116. Trilépata | 119. Trielespejo |
| 140. Tentelento | 017. Mochimacho | 141 Tentemacho |
| 143. Quierodeso | 482. Batallitos | 144. Gambulloso |
| 145. Indiligencio | 165. Globtundente | 146. Tanquivocado |
| 170. Inquielifante | 171. Perselefante | 172. Mamuguanto |
| 184. Castelius III | 194. Castelius III | 185. Castelius II |
| 185. Castelius II | 185. Castelius II | 186. Castelius I |
| 213. Deslumbrella | 095. Cupístolo | 214. Rechinella |
| 238. Tomanota | 520. Malmet | 239. Zalameria |
| 243. Jibanyan | 450. Ejemtos | 248. Espinyan |
| 243. Jibanyan | 152. Rebelcebú | 249. Pelochnyan |
| 320. Níscala | 266. Pufipatitas | 321. Curaníscala |
| 338. Enerposa | 339. Eneposa | 340. Mejorposa |
| 355. Felisonte | 478. Negatalia | 356. Reversa |
| 306. Sombrillo | 182. Montaña Loca | 364. Sombrillogro |
| 383. Acelgo | 040. Flamileón | 384. Morenaso |
| 385. Envelo | 416. Tengulecto | 386. Cafeíno |
| 406. Bilgatino | 385. Envelo | 407. Su Hackeltad |
| 514. Sierpesado | 558. Charlatón | 515. Cobravil |
Hay otros casos en los que podrás fusionar un Yo-kai con un objeto.
| Yo-kai 1 | Objeto | Se fusionan en |
|---|---|---|
| 013. Pataleto | Espada iracunda | 014. Osfurio |
| 015. Sacoco | Perla peligrosa | 016. Gran Coco |
| 020. Puergazán | Farolillo de pez | 021. Torreznio |
| 022. Samuranguila | Emblema dorado | 023. Anguilocio |
| 031. Chupatinas | Premio JMV | 032. Chupapremios |
| 043. Ludorái | Espada legendaria | 044. Lustre |
| 043. Ludorái | Espada maldita | 045. Furtre |
| 043. Ludorái | Espada sagrada | 046. Dortre |
| 053. Lucharabajo | Alma de general | 054. Camperabajo |
| 095. Cupístolo | Potenciador de amor | 096. Casanovo |
| 102. Ondívoro | Orbe eléctrico | 103. Coberturo |
| 040. Flamileón | Topping de estrellitas | 112. Leongüista |
| 147. Aterracota | Cerámica antigua | 148. Explotacota |
| 149. Nihablar | Piedra angular | 150. Impás |
| 152. Rebelcebú | Topping de estrellitas | 155. Grafilcebú |
| 166. Sumodón | Gorro de paja | 167. Supersumodón |
| 168. Desinverest | Figura de terracota | 169. Inverestupción |
| 186. Castelius I | Lingote de platino | 187. Maxicastelius |
| 189. Pegarabajo | Alma invencible | 190. Enormarabajo |
| 194. Robonyan | Topping de estrellitas | 196. Showbonyan |
| 221. Escanlofrío | Capa de ventisca | 222. Frihuahua |
| 224. Superniñato | Bola del mal | 225. Superniñato Rebelde |
| 236. Pupilo Panja | Farolillo del maestro | 237. Panja Pro |
| 251. Komasan | Alma arremolinada | 252. Komaleón |
| 257. Komajiro | Alma arremolinada | 258. Komatigrado |
| 266. Pufipatitas | Cetro del amor | 267. Pufilindo |
| 275. Fristina | Horquilla glacial | 276. Granizia |
| 316. Abuzampa | Arroz del amor | 317. Gargazampa |
| 316. Abuzampa | Topping de estrellitas | 319. Abuzampa XXL |
| 322. Arenito | Traje caqui | 323. Don Arenito |
| 324. Albornocita Azul | Aceite de baño | 325. Florentina |
| 331. Contentallo | Hibisco rojo | 332. Talloestrella |
| 336. Nomi | Esencia del mal | 337. Pillastre |
| 342. Torivinador | Agua sobrenatural | 343. Torivino |
| 092. Cotilleja | Topping de estrellitas | 354. Repostilleja |
| 380. Algio | Pesas pesadas | 381. Agujeto |
| 399. Keji Do Khan | Oso tallado | 400. Gruñón Khan |
| 401. Enciélago | Armario cómodo | 402. Caseriélago |
| 434. Timidiablo | Esquirla del mal | 435. Osademonio |
| 418. Espaoi | Malas noticias | 445. Espayá |
| 460. Estréquito | Bocina | 461. Vrumbo |
| 480. Aranecido | Arena de duna | 481. Desaranecido |
| 491. Lena | Diario maldito | 492. Malena |
| 497. Arruñona | Polvos antiedad | 498. Belladona |
| 528. Minipulpobola | Plancha takoyaki | 529. Pulpobola Rey |
| 533. Desolvidador | Aspiramemorias | 534. Memorio |
| 563. Robodraqui | Orbe del dragón | 538. Lord Dragón |
| 540. Nereida | Perla de sirena | 541. Sirenia |
| 543. Bebesaurio | ADN de dinosaurio | 544. Destrozasaurio |
| 558. Charlatón | Topping de estrellitas | 560. Tochacolate |
| 031. Chupatinas | Esencia del mal | 580. Chupatodo |
| 035. Atierrador | Esencia del mal | 581. Aterrahorror |
| 101. Nébula | Esencia del mal | 582. Apéstula |
| 301. Kappafalso | Esencia del mal | 583. Kappamalo |
| 306. Sombrillo | Esencia del mal | 584. Sombrío |
| 342. Torivinador | Esencia del mal | 586. Toragorero |
| 468. Peluco | Esencia del mal | 587. Cardado |
| 540. Nereida | Esencia del mal | 588. Trampeida |
| 546. Cisnia | Esencia del mal | 589. Malisnia |
| 149. Nihablar | Topping de estrellitas | 624. Frauduralla |
| 311. Cimbrón | Topping de estrellitas | 639. Deporchugo |
| 340. Mejorposa | Topping de estrellitas | 641. Maripasada |
| 098. Losiento | Topping de estrellitas | 653. Milperdones |
Hay otros casos en los que podrás fusionar un objeto con otro objeto.
| Yo-kai 1 | Objeto | Se fusionan en |
|---|---|---|
| Alma Lavadenco | Alma Filete II | Alma ardiente |
| Alma Bebesaurio | Alma Insaciablo | Alma arrasadora |
| Alma Cupístolo | Alma Pufilindo | Alma célebre |
| Alma Impás | Alma Robonyan | Alma centinela |
| Alma Estatinarca | Alma Papá Rayo | Alma chisposa |
| Alma Segadora | Alma Huracán Güey | Alma cortadora |
| Alma Ojezno | Alma Flequipilante | Alma cósmica |
| Alma Estatiniño | Alma Robonoko | Alma de carga |
| Alma Rúbeo J | Alma Dex Cápito | Alma fiebre roja |
| Alma Cobravil | Alma Robin Ful | Alma fusión |
| Alma Granizia | Alma Frihuahua | Alma gélida |
| Alma Kappafalso | Alma Florentina | Alma húmeda |
| Alma Tenterila | Alma Casanono | Alma impecable |
| Alma Afronauta | Alma Pandalón | Alma ingrávida |
| Alma Pandanoko | Alma Estrenoko | Alma invocadora |
| Alma Vrumbo | Alma Akusika | Alma punzante |
| Alma Curaníscala | Alma Samulimpio | Alma purificadora |
| Alma Nébula | Alma Tenguriginal | Alma rotatoria |
| Alma Nomevén | Alma Nostoy | Alma sigilosa |
| Alma Pellurón | Alma Maxicastelius | Alma sin igual |
| Alma Genedáver | Alma Tengullón | Alma siniestra |
| Frag. p. avaricia ∞ 1 | Frag. p. avaricia ∞ 2 | Piedra avaricia ∞ |
| Frag. p. atont. ∞ 1 | Frag. p. atont. ∞ 2 | Piedra atontadora ∞ |
| Frag. p. glorios. ∞ 1 | Frag. p. glorios. ∞ 2 | Piedra gloriosa ∞ |
| Frag. p. renac. ∞ 1 | Frag. p. renac. ∞ 2 | Piedra renacer ∞ |
| Frag. piedra S ∞ 1 | Frag. piedra S ∞ 2 | Piedra S ∞ |
| Alma Avarqueroso | Alma Cafeíno | Superalma |
Algunos de los Yo-kai evolucionarán al llegar a cierto nivel.
| YO-KAI QUE EVOLUCIONAN |
| Yo-kai | Nivel | Evoluciona a |
|---|---|---|
| 003. Alcaldero | 17 | 004. Sinná |
| 006. Katano | 20 | 007. Katananái |
| 009. Milimpiano | 22 | 010. Samulimpio |
| 011. Dormileón | 35 | 012. León Alfa |
| 024. Bola Blanda | 25 | 025. Bateadós |
| 029. Cortarroz | 34 | 030. Socarrat |
| 033. Guerrero Güey | 35 | 034. Huracán Güey |
| 074. Yopaso | 16 | 075. Puf |
| 077. Komemo | 20 | 078. Komecasa |
| 080. Mochueloqué | 28 | 081. Todoídos |
| 092. Cotilleja | 25 | 093. Marulleja |
| 098. Losiento | 33 | 099. Domiplof |
| 100. Niebli | 32 | 101. Nébula |
| 152. Rebelcebú | 25 | 153. Caporrista |
| 156. Chocovaca | 29 | 157. Vacaloca |
| 158. Fracalavero | 28 | 159. Calabilidoso |
| 173. Rayael | 34 | 174. Cazarayos |
| 175. Calmarinero | 28 | 176. Almirante Admirable |
| 216. Ningarra | 23 | 217. Habilgarra |
| 219. Apanleado | 30 | 220. Panduro |
| 233. Baku | 26 | 235. Somnia |
| 240. Kappandante | 31 | 241. Kappadachín |
| 311. Cimbrón | 17 | 312. Algacabana |
| 333. Nomedá | 31 | 334. Paupermán |
| 336. Nomi | 32 | 337. Gran Nomi |
| 387. Trenditópico | 20 | 388. Retuiterio |
| 389. Negatisquito | 18 | 390. Deprisquito |
| 392. Nomevén | 24 | 393. Nostoy |
| 404. Prestragón | 33 | 405. Bolsadrón |
| 452. Goto | 23 | 453. Sirimiri |
| 454. Copo | 22 | 455. Ventisquero |
| 457. Cartepollo | 24 | 458. Mirlobirlo |
| 465. Cantonio | 21 | 466. Multiniche |
| 468. Peluco | 30 | 469. Foliculio |
| 470. Dabombo | 30 | 471 Los Bomboledores |
| 516. Noko | 28 | 517. Florinoko |
| 520. Malmet | 29 | 521. Agorerana |
| 530. Pezqueroso | 27 | 531. Pezgativo |
| 535. Mosquereta | 34 | 536. Bronquereta |