Star Fox 64 3D es un apasionante juego de acción. Es una versión mejorada del juego que apareció en la consola Nintendo 64, añadiendo a unos nuevos gráficos, sonidos y músicas, la capacidad 3D y Wireless de la consola. Además de la traducción y doblaje del juego completo al español.

El desarrollo del juego consiste en llegar al final de cada planeta, sin embargo, en cada uno podrás hacer alguna misión especial para encontrar una salida secreta hacia otra ruta.

Esto hace que el juego no se haga repetitivo y puedas jugar muchas veces con él, ya que aunque llegar al final del juego puedes hacerlo completando 7 planetas, las combinaciones posibles hacen que haya 25 recorridos diferentes.

No todas las rutas son igual de difíciles, no sólo por encontrar el camino correcto en ellas, sino que además, hay planetas en donde los enemigos son mucho más complicados que en otros.

La acción en cada planeta se desarrolla normalmente avanzando "por railes", es decir, la cámara sigue un camino pre-establecido y no puedes recorrer libremente el planeta (Modo fijo). Sin embargo, hay determinados momentos (o planetas) en donde se pasa al modo Abierto, donde puedes moverte con libertad en una zona circular. En esta caso, la cámara te irá siguiendo y podrás ver un mapa de tu localización y la de los personajes importantes que haya en la zona.

Dependiendo de la ruta que sigas para llegar al planeta final, tendrás que enfrentarte con Andross de una manera diferente. Si quieres ver el verdadero final del juego tendrás que derrotarlo por la ruta más difícil.

En cada planeta existe un reto que superar, si logras una puntuación muy alta y lo superas, conseguirás una medalla en ese planeta.

Al empezar una partida nueva y elegir el modo de juego Nintendo 3DS o Nintendo 64 puedes ver las medallas que has conseguido en total en cada un de ellos (sólo se marca una por planeta, el máximo son 15 medallas).

Estas medallas también puedes conseguirlas en el Modo Desafío. Conseguir una en cada planeta es el objetivo de ese modo de juego.

La puntuación necesaria en cada planeta es la siguiente (la puntuación para conseguir las medallas del Modo Historia es la misma que para conseguir la de plata en el Modo Desafío), pero recuerda que se consiguen de forma independiente.
| Planeta | Oro | Plata | Bronce |
| Corneria | 190 | 150 | 100 |
| Meteo | 300 | 200 | 180 |
| Sector Y | 180 | 150 | 100 |
| Katina | 190 | 150 | 90 |
| Fichina | 60 | 50 | 40 |
| Aquas | 160 | 150 | 100 |
| Solar | 110 | 100 | 50 |
| Sector X | 230 | 150 | 100 |
| Zoness | 290 | 250 | 150 |
| Titania | 180 | 150 | 80 |
| Sector Z | 110 | 100 | 60 |
| Macbeth | 180 | 150 | 100 |
| Área 6 | 400 | 300 | 180 |
| Bolse | 190 | 150 | 120 |
| Venom 1 | 180 | 150 | 120 |
| Venom 2 | 220 | 200 | 120 |