En todo el mapa de Hyrule vas a encontrarte con grandes enemigos que no son necesarios vencer para avanzar, pero que te pueden dar valiosas recompensas.
Hay 4 tipos diferentes de enemigos (Petrarok, Hinox, Moldora y Centaleón), sin embargo, cada uno de ellos se subdivide en más tipos. Los tipos de tamaño pequeño son muy fáciles de derrotar y no aparecen marcados en el mapa de cada región.


| Tipo Subjefe | Subtipos | Dificultad | Recompensas posibles |
| Petrarok | Petrarok | Media | Pedernal, ámbar ópalo y rubí. |
| Petrarok luminoso | Media | Pedernal, ámbar, ópalo, gema luminosa, topacio y diamante. | |
| Petrarok poco común | Difícil | Pedernal, ámbar, ópalo, topacio, rubí, zafiro y diamante. | |
| Magmarok | Difícil | Pedernal, ópalo, rubí y diamante. | |
| Glaciarok | Difícil | Pedernal, ópalo, zafiro y diamante. | |
| Litorok | Fácil | Pedernal, ámbar y ópalo. | |
| Lavarok | Fácil | Pedernal, ámbar y rubí. | |
| Gelirok | Fácil | Pedernal, ámbar y rubí. | |
| Hinox | Hinox | Media | Uña de hinox, colmillo de hinox, víscera de hinox, manzana, frambuesa, coco, fruta electro, plátanos recios, calabaza robusta y durián vivaz. |
| Hinox azul | Media | Uña de hinox, colmillo de hinox, víscera de hinox, lubina de Hyrule asada, lubina vivaz asada, salmón vivaz asado, trucha asada, carpa asada, dorada asada, caracol sigiloso asado, caracol vivaz asado y cangrejo asado. | |
| Hinox negro | Difícil | Uña de hinox, colmillo de hinox, víscera de hinox, carne de caza asada, carne de caza XL asada, carne de caza XXl asada, carne de ave sasada, carne de ave Xl asada y carne de ave XXL asada. | |
| Hinox esquelético | Difícil | Colmillo de hinox. | |
| Moldora | Moldora | Difícil | Aleta de moldora, víscera de moldora y cofres. |
| Centaleón | Centaleón | Difícil | Cuerno de centaleón, pezuña de centaleón y víscera de centaléon. |
| Centaleón azul | Difícil | Cuerno de centaleón, pezuña de centaleón y víscera de centaléon. | |
| Centaleón blanco | Muy difícil | Cuerno de centaleón, pezuña de centaleón y víscera de centaléon. | |
| Centaleón plateado | Muy difícil | Cuerno de centaleón, pezuña de centaleón, víscera de centaléon, ámbar, ópalo, topacio, rubí, zafiro y diamante. |