Después de destruir a la criatura, puedes mirar en el mapa de la zona (presionando el botón +) cuál es el siguiente punto al que debes ir. Regresa hacia la cabina de navegación y rellena tu energía de nuevo parándote en la plataforma central.

Continúa retrocediendo (en dirección hacia el comienzo), pasando de nuevo por la gran sala con muchas plataformas y llegará un momento que no podrás seguir avanzando. Ahora hay una puerta que está cerrada. Sin embargo, puedes convertirte en Morfosfera y entrar por el conducto de metal que está apoyado en el suelo.

Continúa por su interior y destruye una reja con una Bomba para coger un Tanque de energía y pasar a la sala de al lado. Es la sala de control de sistemas. Al llegar, vuelve a transformarte en Samus y acércate al ordenador del lado derecho para activarlo.

La cámara girará y de frente verás aparecer enemigos voladores que te atacan. Puedes destruirlos fácilmente, pero seguirán saliendo más de los nidos que hay al fondo.

Para acabar con estos nidos, usa el modo exploración y fija el blanco en ellos para lanzarles misiles. Puedes dispararle con tu disparo normal, pero así no lograrás destruirlos.

Tienes que acertar con varios misiles a cada uno de los dos nidos para destruirlos (recuerda que puedes recargar tus misiles pulsando el botón A si el mando de Wii está en posición vertical). Una vez destruidos vuelve a acercarte al ordenador y podrás restablecer la energía de la nave.

Ahora regresa de nuevo a hablar con Adam (el jefe de la patrulla de la Federación Galáctica).