Tras una corta secuencia inicial tomarás el control de Alph, el ingeniero de la Drake, la nave con la que llegasteis a este planeta.
Mapa del Bosque de la Vida.

Avanza hasta encontrarte con un Pikmin de color rojo y luego síguelo hasta volver a encontrarle junto a dos Pikmin más.

Allí verás que sobre ellos hay una especie de fruta roja enganchada a una rama, y si llamas a los tres Pikmin y los lanzas hacia la fruta, lograrás tirarla y formar una cebolla roja en el suelo.

Después de eso verás un puente cortado a uno de los lados y unos escombros al lado contrario. Lanza a los Pikmin hacia estos últimos y así empezarán a llevarse fragmentos hacia el puente.

Una vez consigas que los Pikmin trasladen todos los fragmentos al puente, lograrás reconstruirlo y podrás cruzarlo.

Al otro lado del puente hallarás el KopPad, un aparato con el que podrás averiguar dónde está la Drake.

En la pantalla táctil de tu Wii U GamePad verás un mapa. Toca la pantalla y deslízala de arriba a la izquierda hacia el centro, y así podrás encontrar el paradero de la nave.

Cuando vuelvas a tomar el control de tu personaje verás varias flores con unas pastillas rojas denominadas Pildifloras. Si lanzas Pikmin hacia ellas las tirarán y se las llevarán a la cebolla roja que se formó antes. De esta manera, harás que escupa unas semillas de las que luego brotarán más Pikmin ¡Así es como se reproducen!

Luego deberás repetir este proceso hasta lograr hacerte con un mínimo de 20 Pikmin rojos (la pastilla roja con un 5 que hay en una flor precisará que sea transportada por un mínimo de 5 Pikmin).

Cuando tengas un grupo de al menos 20 Pikmin podrás usarlos para mover una gran caja de cartón que hay al norte del mapeado. De esa manera podrán empujarla y desbloquear el camino.

Además, podrás encontrar el primer Apunte de exploración del juego, gracias al cual podrás obtener información valiosa sobre los Pikimin (Pikminología 1) y los controles del juego (Moverse, Silbato, Lanzar, Arrancar 1, Cambiar punto de vista, Fijar objetivo, Disolver el grupo, Cómo usar el KopRadar 1 y 2 y Uso de la cámara).

Luego sigue avanzando hasta encontrar la entrada de una cueva y una vez dentro continúa por el único camino posible hasta llegar a un muro de barro que deberás derribar lanzando tus Pikmin contra él (cuantos más lances, menos tardarán en derribarlo).

Tras derribar el muro podrás salir de la cueva y encontrar la Drake, y una vez allí recibirás una llamada de Brittany en el KopPad.

Después el día terminará, montarás en la nave y los Pikmin te seguirán montados en su cebolla roja.

Siempre que termine un día verás las reservas de provisiones que te quedan y un resumen de lo que has conseguido en él. Además, tendrás la opción de ver repetido todos lo que has hecho en el Wii U GamePad (obtendrás la entrada Cómo usar el KopRadar 3).
