Después de actualizar el juego a la versión 1.3.0., podrás empezar a nadar en las acogedoras aguas de la costa de tu isla y sumergirte para descubrir y conseguir criaturas marinas que habitan en el ecosistema de tu isla, las cuales podrás donar luego al museo.
Para poder bucear, primero tienes ponerte un traje de buceo como el traje de buceo a rayas, el traje de buceo de Nook Inc., o el traje de buceo hoja. Lo más rápido es el traje de buceo a rayas, ya que lo venden en la vitrina de la tienda MiniNook (los otros dos te los envían por correo al día siguiente).
Cuando tengas un traje, equípate con él, ve a la orilla del mar y pulsa 
para meterte dentro y ponerte a nadar.
Una vez dentro del mar podrás nadar solo con los pies, dejando pulsado el botón , o dando brazadas, que es más rápido, pulsando repetidamente dicho botón. También podrás bucear pulsando el botón 
.
Cuando veas una sombra en el fondo del mar de la que salen burbujas, bucea con e impúlsate con hasta lograr llegar hasta ella. Así podrás capturar esa criatura marina.
Podrás ver las criaturas marinas que hayas capturado dentro de la Capturapedia.
En la siguiente tabla podrás ver en qué meses puedes capturar cada especie submarina, el horario, el tamaño de su sombra bajo el agua, y el precio por el que los puedes vender en la tienda.
Las sombras de las criaturas pueden tener tres tamaños: pequeña (S), mediana (M) y grande (L).
| Abulón |
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| Alga wakame |
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| Anémona |
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| Anguila jardinera |
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| Babosa de mar |
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| Bellota de mar |
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| Bogavante |
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| Buccino |
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| Buey del Pacífico |
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| Calamar luciérnaga |
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| Calamar vampiro |
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| Camarón boreal |
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| Canasta de flores de Venus |
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| Cangrejo boreal |
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| Cangrejo de nieve |
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| Cangrejo gazami |
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| Cangrejo gigante japonés |
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| Cangrejo herradura |
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| Caracola espinosa |
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| Cerdo de mar |
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| Erizo de mar |
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| Erizo lápiz de pizarra |
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| Estrella de mar |
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| Gusano políclado |
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| Isópodo gigante |
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| Langosta espinosa |
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| Langosta mantis |
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| Langostino tigre |
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| Medusa luna |
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| Mejillón |
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| Nautilo |
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| Ostra |
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| Ostra perlera |
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| Pepino de mar |
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| Piña de mar |
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| Pulpo |
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| Pulpo paraguas |
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| Taclobo gigante |
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| Uva de mar |
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| Vieira |
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