Cada cierto tiempo el juego se actualizará gratuitamente de forma automática añadiendo mejoras y correcciones de pequeños errores que puedan existir. Alguna de estas actualizaciones incluye añadidos importantes como nuevas formas de control o piezas nuevas para los vehículos. Ten siempre la consola conectada a internet para no perderte todas las mejoras que puedan aparecer.
Puedes ver la versión de tu juego mirando en la esquina inferior derecha de la pantalla del título.

A continuación, podrás ver un resumen de las actualizaciones que ha habido desde la salida del juego.
| Versión | Fecha | Novedades importantes |
| 1.7.0 | 19-09-2018 | Se añade la compatibilidad con el coche Toy-Con incluido en Nintendo Labo Toy-Con 03: kit vehículos. |
| 1.6.0 | 18-07-2018 | Añadido nuevo personaje: Link (Túnica de campeón). Añadido nuevo vehículo: Moto Hyliana Alfa. Añadido nuevo tipo de rueda: Ancestral. Añadida nueva ala: Paravela. Varias mejoras adicionales en la experiencia de juego del usuario. |
| 1.5.0 | 26-06-2018 | Se añade la compatibilidad con la Moto Toy-Con incluida en Nintendo Labo Toy-Con 01: kit variado. Para poder jugar en línea es necesario actualizar el programa. Corrección de pequeños errores. |
| 1.4.0 | 13-12-2017 | Nuevos idiomas disponibles. Corrección de pequeños errores. |
| 1.3.0 | 19-10-2017 | Se añade la posibilidad de realizar videocapturas. Mantén pulsado el botón de captura para grabar hasta 30 segundos previos. La consola debe contar con la Ver. 4.0.0 o posterior para usar esta función. Varias mejoras adicionales en la experiencia de juego del usuario. |
| 1.2.1 | 10-08-2017 | Corrección de pequeños errores. |
| 1.2.0 | 29-06-2017 | Añade compatibilidad con los amiibo de Pikmin. Varias mejoras adicionales en la experiencia de juego del usuario. |
| 1.1.0 | 18-05-2017 | Corrección de pequeños errores. Varias mejoras adicionales en la experiencia de juego del usuario. |
Conducción con el Coche Toy-Con (versión 1.7.0)
A partir de esta versión del juego podrás usar tu coche Toy-Con para controlar tu juego. Para ello debes colocar el control del primer jugador los dos Joy-Con unidos (si están separados no funcionarán, aunque después realmente cada uno vaya a un Toy-Con).

Después entra en menú Labo de la pantalla de título y allí elige para el primer jugador el coche de Nintendo Labo Toy-Con 03: kit vehículos (si tienes más mandos y más Toy-Con puedes configurar hasta 4 jugadores del mismo modo que el primero).


Por último, justo antes de entrar en la carrera debes desacoplar los mandos y colocarlos dentro del Toy-Con del coche. Ahora podrás controlar tu vehículo con tu Toy-Con.

Para acelerar solo debes presionar el pedal levemente (no aceleras más por pisar más el pedal), sin embargo, para derrapar tienes que pisarlo hasta el fondo. Los objetos se lanzan con el botón situado en el centro del volante.
También podrás cambiar la vista con el botón X, pero es recomendable que lo hagas antes de comenzar la carrera.
Los demás accesorios del coche no sirven para nada en Mario Kart Deluxe (las palancas, la cuerda con tirador, ni la palanca de freno).
En este modo de control no podrás frenar, no tendrás retrovisor y tampoco podrás dirigir los objetos que lances.
Recuerda que también puedes activar y desactivar la aceleración y la conducción automática. Entra en el menú de pausa para cambiar estos valores si quieres. Ahí podrás ver una descripción de todos los controles.

Nuevo personaje, vehículo y componentes (versión 1.6.0)


Conducción con la Moto Toy-Con (versión 1.5.0)
A partir de esta versión del juego podrás usar tu Moto Toy-Con para controlar tu juego. Para ello debes colocar el control del primer jugador los dos Joy-Con unidos. Después entra en menú Labo de la pantalla de título y allí elige para el primer jugador la moto de Nintendo Labo Toy-Con 01: kit variado (si tienes más mandos y más Toy-Con puedes configurar hasta 4 jugadores del mismo modo que el primero).


Por último, justo antes de entrar en la carrera debes desacoplar los mandos y colocarlos dentro del Toy-Con de la moto. Ahora podrás controlar tu moto (o coche) con tu Toy-Con. Recuerda que también puedes activar y desactivar la aceleración y la conducción automática. Entra en el menú de pausa para cambiar estos valores si quieres. En este modo de control no tendrás retrovisor.
