Comienzas el juego viendo una presentación en vídeo donde Mario encuentra manchas de tinta en el suelo y las sigue encontrando el dibujo de una "M" con pintura negra. Antes de poder reaccionar se forma una gran mancha que acaba tragándose a nuestro protagonista.


Así caerás en una zona boscosa junto a una gran huella de Bowser. Es el Islote Bigotes y aquí tendrás que conseguir obligatoriamente el primer sol del juego. Sal del suelo tocando la palanca de control y usa la palanca derecha para mirar alrededor. Estos primeros pasos te servirán de tutorial para controlar a Mario.


Ahora ve avanzando por el camino que tienes delante y llegarás a un viejo barco al que puedes subir sin problemas simplemente saltando. Recorre la cubierta y enseguida verás como un enfurecido Bowser se acerca y comienza a lanzar fuego de su boca. Del cielo caerán bloques ardiendo que te dañan si te tocan y que te impedirán avanzar con tranquilidad. Al final del recorrido hay un faro y unos bloques con la cara de Bowser. El primero te servirá para cubrirte del fuego, realmente puedes cubrirte detrás de cualquier cosa (incluso aunque se rompa te cubrirá de una primera ráfaga). Fíjate en donde no se ilumina el suelo de rojo y sabrás que es una zona segura donde cubrirte.


El fuego romperá los bloques de Bowser si los toca (puedes estar tras el faro o directamente detrás de ellos y no sufrirás daño).


Una vez destruidos verás el sol felino que necesitas coger y unos escalones para subir fácilmente a por él. En cuanto lo toques su poder encenderá la luz del faro logrando hacer huir al Bowser enfurecido.


En cuanto lo toques su poder encenderá la luz del faro logrando hacer huir al Bowser enfurecido.


Ahora brillará el sol en toda la zona y verás que emergen del fondo del agua unas islas a las que puedes llegar dejándote caer desde donde te encuentras (ya volverás al Islote más adelante). Allí encontrarás a Bowsy que te pide ayuda para parar al enfurecido Bowser. Después de su explicación se unirá a ti y podrás elegir que te ayude en tu aventura o no y, si lo haces, que participe más o menos. Depende de la dificultad del juego que quieras elige una u otra opción, básicamente te ayudará a derrotar los enemigos que vas encontrando.


En el modo de dos jugadores otra persona podrá controlar a Bowsy.

Detrás de él verás un gran arco, dirígete a él para localizar los soles en Acantilados Afilauñas.