Los mapas especiales te mostrarán la localización de ciertos sitios, como por ejemplo las zonas en las que puedes encontrar las Tiendas de Terry, Piezas de corazón, etc.

Mapa del barco fantasma.
Localización: Se encuentra en una zona subterránea que hay en la Isla Rombo (F-1). Pincha aquí para más información.

Utilidad: Te muestra las localizaciones en las que puedes encontrar al barco fantasma dependiendo de la fase lunar en la que te encuentres.

| Luna llena | Isla de la Luna (A-5) |
| Luna gibosa menguante | Isla Rombo (F-1) |
| Cuarto menguante | Isla Bomba (E-6) |
| Luna menguante | Isla Calabaza (B-3) |
| Luna nueva visible | Archipiélago Casiopea (G-7) |
| Cuarto creciente | Archipiélago Orión (C-7) |
| Luna gibosa creciente | Islas Pez Volador (D-2) |
Mapa de Tingle.
Localización: Te lo da Tingle al rescatarle de una celda que hay en Isla Taura (B-4).

Utilidad: Te muestra la localización de la Isla de Tingle y de las Hadas que te aumentan el número de rupias que puedes llevar.

Mapa a-lu-ci-nante.
Localización: Te llegará por correo tras haber conseguido la Espada maestra, pero al ser una carta con franqueo en destino tendrás que pagar 201 rupias por ella.

Utilidad: Te muestra la localización de todos los Mapas y fragmentos de la Trifuerza.

Mapa de calamares.
Localización: Isla Triángulo del Norte (C-4), usando el Mapa del tesoro nº. 26 que se puede conseguir en las Islas del Seis (D-4).

Utilidad: Te muestra la localización de todas las zonas en las que puedes encontrar calamares gigantes junto con el número de ojos que tienen. Derrotándoles podrás conseguir cosas importantes (piezas de corazón, rupias, etc.).

Mapa de las grandes hadas.
Localización: Islas del Cuatro (B-1), usando el Mapa del tesoro nº. 41 que se puede conseguir en las Islas del Cinco (F-2).

Utilidad: Te muestra la localización de las zonas en las que puedes encontrar a las Grandes Hadas.

Mapa isleño de corazones.
Localización: Andamio de Vuelo (B-7), usando el Mapa del tesoro nº. 19 que se puede conseguir en las Islas del Cuatro (B-1).

Utilidad: Te muestra la localización de todas las islas en las que puedes encontrar Piezas de corazón y el número que hay en cada una (no se mostrarán las piezas que se rescatan del mar con la Garra).

Mapa marino de corazones.
Localización: Zona de Regata (G-6), usando el Mapa del tesoro nº. 32 que se puede conseguir en las Islas del Tres (D-1).

Utilidad: Te muestra la localización de los Mapas del tesoro que ocultan Piezas de corazón sumergidas en el mar (de las que se rescatan con la Garra).

Mapa de cuevas secretas.
Localización: Isla de las Torres (A-7), usando el Mapa del tesoro nº. 13 que se puede conseguir en las Islas del Dos (G-4).

Utilidad: Te marca la localización de las zonas con cuevas secretas en las que puedes conseguir cosas importantes (piezas de corazón, mapas del tesoro, rupias, etc.).

Mapa de círculos de luz.
Localización: Isla del Uno (D-3), usando el Mapa del tesoro nº. 21 que se puede conseguir allí mismo, en esa isla.

Utilidad: Te muestra la localización de todas las zonas en las que puedes encontrar círculos de luz que aparecen misteriosamente sobre el mar en las noches de luna llena. En esos lugares podrás encontrar bastantes rupias.

Mapa de atalayas.
Localización: Dirígete al Andamio de Vuelo (B-7) y busca a un submarino. Luego entra en su interior y elimina a todos los enemigos existentes para hacer aparecer un cofre con el mapa.

Utilidad: Te muestra la localización de todas las zonas en las que puedes encontrar atalayas que se elevan sobre el mar.

Mapa de Terry.
Localización: Te llegará por correo después de obtener la Bomba en el barco pirata de Isla Taura.

Utilidad: Te muestra la localización de todas las zonas en las que puedes encontrar a la Tienda de Terry que viaja por los mares.

Mapa de submarinos.
Localización: Dirígete a la Zona de regatas (G-6) y ve a la pequeña isla que hay al norte para encontrar un agujero que te llevará a una zona subterránea (puedes llegar ahí planeando con la Hoja deku desde el lado sur, o enganchándote al palo de una pancarta con el Gancho).

Dentro encontrarás tres huecos elevados con unos interruptores. Usa el Bumerán para golpear a los tres y así harás aparecer un cofre con el mapa.

Utilidad: Te muestra la localización de todas las zonas en las que puedes encontrar submarinos.
